Pondok Pesantren Babussalam menaungi beberapa satuan pendidikan. Satuan Pendidikan Formal meliputi: TK Islam Terpadu Babussalam, SD Islam Terpadu Babussalam, SMP Islam Terpadu Babussalam, SMA Islam Terpadu Babussalam. Untuk Satuan Pendidikan Pondok Pesantren meliputi Ula, Wustho, dan Ulya